Наличие рельс по оси не гарантирует её жесткости, если у станка большой просвет портала, а шпиндель закреплен на тонкой пластине, или портал имеет недостаточную жесткость на кручение или у стоек боковых в этом направлении недостаточная жесткость, то может возникать колебательная неустойчивость... Для пробы при нижнем положении шпинделя в него уприте часовой индикатор и потяните поперек портала и посмотрите на сколько утянется.... Если утянется прилично, то вот вам и ответ...
Кстати, как-то наблюдал на сервачном станке с 6кВт шпинделем и порталом из труб 100 на 150 и толщиной стенки 6мм, как эта труба на ширине портала 2 метра на заметных скоростях торсионно скручивалась на 0.6мм при грубой выборке офсетом по массиву МДФ....
Ну и вообще люфты проревизируйте, а то где-то болты пораскрутилилсь, а у вас уже алярмистское состояние....